Meno di un anno dopo aver ampliato la sua partnership con il Broad Institute di Harvard e del MIT per promuovere l’uso di high-performance computing per la genomica analytics, Intel annuncia alcune pietre miliari.
Intel e Ampio, hanno sviluppato una nuova architettura di riferimento, chiamato Ampio Intel Genomica Stack (BIGstack), che fornisce un 5X miglioramento Broad genomica analytics pipeline. Utilizza Cpu Intel, Omni-Percorso di Tessuto, e Ssd. Lo stack comprende anche le ottimizzazioni per la Intel integrata della CPU e Fpga.
La nuova architettura supporta volumi di dati “veramente scala senza precedenti”, ha scritto Jason Waxman, corporate VP e GM del Data Center Solutions Group di Intel, in un post sul blog.
Con questo tipo di progresso nel campo della genomica analytics, ha scritto, “siamo in grado di compiere nuovi passi verso la comprensione molecolare driver del cancro e di altre malattie e accelerare la promessa di precisione medicina”.
BIGstack è ora disponibile per i 45.000 utenti registrati di GATK, Broad, analisi genomica toolkit. Waxman ha chiamato “il tipo di svolta nella convenienza per la genomica analytics comunità” che Intel aveva in mente quando ha commesso i 25 milioni di dollari per i suoi cinque anni di collaborazione con il Broad Institute scorso anno.
Nel frattempo, Intel ha anche annunciato che il Broad Institute è aperto-sourcing GATK4.
Inoltre, BGI-un leader in Cina genomica industria-è l’adozione di GATK strumenti, tra cui GATK4, Ampio flusso di lavoro del sistema di gestione Cromwell e la WDL (definizione del flusso di lavoro di lingua) sul BGI piattaforma Online. La mossa dovrebbe aiutare ad allineare la ricerca genomica in tutto il mondo, Waxman ha detto.
Un approccio problem-solving operai dovrebbero imparare da ingegneri robotici
A volte la soluzione più profonda è di cambiare l’intero problema.