Weniger als ein Jahr nach ausbau der Partnerschaft mit der Broad Institute der Harvard und MIT, um vorab den Einsatz von high-performance-computing für die Genomik-Analysen, Intel ist bekannt, einige Meilensteine.
Intel und Breiten entwickelt haben, eine neue Referenz-Architektur, genannt die Breit-Intel Genomik-Stack (Bigstacks), das liefert einen 5-fachen Verbesserung Breiten die Genomik-Analysen-pipeline. Es nutzt die Intel CPUs, Omni-Path-Fabric und SSDs. Der stack enthält auch Optimierungen für die Intel ‘ s integrierter CPU und FPGA.
Die neue Architektur unterstützt Daten-volumes “auf einem nie da gewesenen Maßstab”, schrieb Jason Waxman, corporate VP und GM der Data Center Solutions Group bei Intel, in einem blog-post.
Mit dieser Art der Förderung der Genom-Analysen”, schrieb er, “können wir neue Schritte in Richtung Verständnis für die molekularen Treiber von Krebs und anderen Krankheiten und die Beschleunigung der Versprechen von Präzisions-Medizin.”
Bigstacks steht jetzt die 45.000 registrierte Nutzer GATK, Broad genomics analysis toolkit. Waxman nannte es “die Art von Durchbruch in der Erschwinglichkeit für die Genomik-Analysen Gemeinschaft”, die Intel im Sinn hatte, als er verpflichtet sich $25 Millionen, um seinen fünf-Jahres-Zusammenarbeit mit dem Broad Institute im vergangenen Jahr.
Inzwischen Intel auch bekannt gegeben, dass das Broad Institute ist open-sourcing GATK4.
Darüber hinaus BGI — führend im chinesischen Genomik-Industrie-ist die Annahme GATK-tools, einschließlich GATK4, Broad workflow-management-system der Cromwell und der WDL (workflow definition language) auf die BGI Online-Plattform. Der Umzug soll ausrichten Genomik-Forschung rund um den Globus, Waxman sagte.
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