Mindre än ett år efter att utvidga sitt samarbete med Broad Institute of Harvard och MIT, för att främja användningen high-performance computing för genomik analytics, Intel tillkännager att vissa milstolpar.
Intel och Brett har utvecklat en ny referens arkitektur, som kallas Brett Intel Genomik Stack (BIGstack), vilket ger en 5X förbättring av det Breda s genomik analytics pipeline. Det använder Intels Processorer, Omni-Väg Tyg, och Ssd-enheter. Den stack också innehåller optimeringar för Intels integrerade CPU och Fpga: er.
Den nya arkitekturen stöder data-volymer “på riktigt aldrig tidigare skådad skala,” skrev Jason Waxman, corporate VP samt GM Data Center-Lösningar Grupp på Intel, i ett blogginlägg.
Med denna typ av framsteg inom genomik analytics, skrev han, “kan vi ta nya steg mot att förstå de molekylära förare av cancer och andra sjukdomar och påskynda löfte av precision medicin.”
BIGstack är nu tillgängliga till 45 000 är registrerade användare av GATK, Breda s genomik analysis toolkit. Waxman kallade det “den typ av genombrott i överkomliga priser för genomik analytics samhället” att Intel hade i åtanke när det begås $25 miljoner till dess fem år i samarbete med Broad Institute förra året.
Under tiden, Intel meddelade också att Broad Institute är öppen-sourcing GATK4.
Dessutom, BGI — en ledare i Kina genomik industrin — antar GATK verktyg, inklusive GATK4, Breda s workflow management system Cromwell och WDL (workflow definition language) på BGI Online-plattform. Flytten ska bidra till att anpassa genetisk forskning runt om i världen, Waxman sagt.
En problemlösningsstrategi IT-arbetare bör lära sig av robotteknik ingenjörer
Ibland är den mest långtgående lösningen är att ändra hela problemet.