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Il Garvan Institute of Medical Research ha annunciato che sarà la ricezione di un nuovo high-performance computing (HPC) per sostenere la ricerca genomica e di analisi.
La genomica è lo studio di informazioni codificate in un individuo del DNA, che permette ai ricercatori di studiare come i geni influiscono sulla salute e malattia, ed è la missione dell’istituto un contributo per la ricerca medica che cambierà le indicazioni della scienza e della medicina e che hanno un impatto importante sulla salute umana.
Il nuovo sistema di supercalcolo, per la consegna da parte di Dell, EMC, saranno utilizzati da parte di Garvan di Dati per la cpu Ingegneria informatica (DADI) del gruppo.
Il Garvan Institute è uno dei più grandi in Australia mediche, istituti di ricerca, focalizzata in particolare sulla ricerca contro il cancro, il diabete e metabolismo, genomica e l’epigenetica, immunologia e infiammazione, l’osteoporosi e l’osso di biologia e neuroscienze.
Secondo il Dottor Warren Kaplan, capo di informatica Garvan è Kinghorn Centro per la Clinica Genomica, genomica, richiede una notevole potenza di calcolo per analizzare i dati.
“Vogliamo cambiare la direzione della medicina, ed il cambiamento nella vita di impatto sulla salute delle persone. Vediamo genomica come la chiave per la guida di questa trasformazione, e non abbiamo potuto ottenere questo risultato senza l’infrastruttura informatica per renderlo possibile”, Kaplan ha detto.
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Secondo il National Human Genome Research Institute, quando il primo genoma umano è stato sequenziato, il progetto, che è iniziato nel 1990 ha preso più di 10 anni e un costo di circa 2,7 miliardi di dollari.
Ora Garvan possibile sequenza fino a 50 genomi al giorno a un prezzo base di circa $1.000.
Per memorizzare, analizzare e utilizzare questa informazione genomica in modo efficace, Garvan richiede grandi risorse di calcolo e di archiviazione dei dati — ogni persona di dati genomici contiene oltre 6 miliardi di basi, e circa 5 milioni di varianti genetiche, prendendo fino a 700 ore.
“La tecnologia ha trasformato il modo di fare scienza,” Kaplan ha continuato. “Ci ha dato la capacità di trasformare Garvan in un data-driven medical research institute, e il più genomi abbiamo sequenza, più saremo in grado di utilizzare le informazioni per informare gli studi futuri.”
Il nuovo sistema è previsto per sostenere i diversi dataset di geni, tra cui il Sydney Genomica di Collaborazione e il Medico del Genoma di Riferimento della Banca, e vi aiuterà Australiano Genomica del Cancro Programma di Medicina e di altre iniziative, l’istituto, ha detto.
I DADI sistema HPC è stato costruito su Dell, EMC, 14 generazione PowerEdge ad alte prestazioni della tecnologia informatica.
Tutta 47 Dell EMC PowerEdge server, la soluzione fornirà i ricercatori clinici con la genomica e la capacità di elaborazione di 1,632 Intel Xeon Scalabile core del Processore; 10 Intel Arria 10 Fpga GX; 122,880 Nvidia Tesla V100 CUDA core; 15,360 Nvidia Tensore core, dovrebbe accelerare HPC e tecniche di IA; 744TB di NVMe accelerare l’elaborazione della memoria del genoma di set di dati; 41TB DDR4 RAM di Memoria; e 530TB capacità utile CephFS di archiviazione.
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