Max Kelsen utilizzando Google Cloud per aiutare a battere il cancro attraverso la macchina di apprendimento

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Australiano società di analisi Max Kelsen utilizza l’intelligenza artificiale (ai) per prevedere l’efficacia di trattamenti per il cancro.

L’azienda è di integrare l’IA e il sequenziamento del genoma del cancro, la ricerca e la pratica clinica, che si concentra inizialmente sull’immunoterapia trattamento per il melanoma e il carcinoma polmonare a piccole cellule.

Uno in quattro Australiani sono diagnosticati con cancro nella loro vita, e mentre l’immunoterapia ha mostrato una grande promessa per migliorare la sopravvivenza del paziente attraverso una varietà di tipi di cancro, tra cui il melanoma e il cancro del polmone, non è garantito per essere efficace per tutti i pazienti — solo 40-42 per cento delle persone risponderà in modo efficace.

Con un singolo ciclo di trattamento di immunoterapia costare in eccesso di AU$100,000, Max Kelsen, guidato dal CEO Nicola Therkelsen-Terry, vuole sviluppare un modello di previsione che indicano la probabile efficacia di trattamenti per il cancro basato su un paziente trucco genetico.

Parlando con ZDNet, Therkelsen-Terry ha detto che in Australia, ci sono circa 12.000 nuovi casi di cancro del polmone ogni anno e di solito a cinque anni tasso di sopravvivenza, l’amministratore delegato ha detto che il suo team ha deciso di destinazione cancro del polmone prima.

Come un singolo intero genoma ammonta a quasi 300 gigabyte, Max Kelsen è l’utilizzo di Google Cloud computing power a sfornare attraverso i dati e sperimentare un “senza precedenti” di scala, in particolare sfruttando TensorFlow, che è stato inizialmente sviluppato da Google Brain Team per uso interno.

Tensore di Ricerca Cloud è la stessa tech alimentazione AlphaGo, evidenziando la quantità di potenza di calcolo applicato da Max Kelsen.

“La chiave per predire il paziente i risultati del trattamento consiste nel trovare e interpretare i modelli e i geni di significato nel genoma di pazienti che hanno risposto meglio a precedenti trattamenti,” Therkelsen-Terry ha detto.

“C’è una gamma di sequenziamento genomico da pannelli occhiata a un paio di selezionare i geni come 23andMe e ancestry.com, attraverso la più ampia exome analisi, attraverso l’intero genoma, e abbiamo iniziato con un punto di vista che si desidera guardare l’intero genoma — per acquisire tutte le informazioni del genoma ha da offrire, non solo quelle di bit che è stato deciso che è la parte più importante.”

L’azienda ha instaurato rapporti di collaborazione con gli archivi di dati in tutto il mondo, quindi è possibile eseguire i test provenienti da più fonti, ma è anche il sequenziamento 400-500 nuovi pazienti con cancro del polmone in un certo numero di ospedali nel Queensland, il monitoraggio del loro trattamento e confronto con modelli ha costruito lungo la strada.

La raccolta di dati provenienti da più fonti di assicurare che la società costruisce un modello generalizzato del genoma, Therkelsen-Terry ha detto.

Nel 2001, l’intero genoma umano è stato prima sequenziato ad un costo di $100 milioni, oggi genomi possono essere sequenziati per meno di $1.000.

“A 19 anni è cambiato profondamente e accoppiato con il fatto che in fondo l’apprendimento, l’apprendimento automatico di ricerca è esplosa negli ultimi cinque anni. Siamo stati in questo punto di genomica stato di maturazione e di apprendimento automatico e di apprendimento profondo era in scadenza, ma in realtà non è una quantità enorme di lavoro al di fuori di alcune cose … era stato fatto in applicazione di tali tagliente tecniche computazionali per la genomica scienza,” Therkelsen-Terry ha detto di come il progetto è decollato.

“Così la nostra squadra davvero iniziato da subito, hanno posto la domanda: Se abbiamo dati genomici in 33 diversi candidati possiamo solo dire che la differenza con la macchina di apprendimento tra i candidati dalla genomica di esempio che sono stati raccolti.”

Therkelsen-Terry, al fianco di Max Kelsen salute piombo Cameron Bean, ha spiegato che il team domanda iniziale che li ha condotti alla seconda area di ricerca stanno impresa: la Classificazione del cancro di origine per il cancro metastatico.

“In Australia abbiamo poche migliaia di persone diagnosticati ogni anno con cancro del primario sconosciuto … se non è possibile determinare dove che la primaria è, allora sei davvero un tiro al buio”, l’amministratore delegato aggiunto. “È anche una cosa personale, è molto doloroso per i pazienti per non ottenere una diagnosi.”

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