Data61 met behulp van machine learning te volgen menselijke infectieziekten in Australië

0
140

De Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation (CSIRO) Data61 heeft een tool ontwikkeld om de track besmettelijke ziekten en hoe ze zich specifiek zou kunnen verspreiden naar Australië, met behulp van Bayesiaanse inferentie, een statistische machine learning methode voor het begrijpen van de neiging van een regio om de verspreiding van ziekten naar andere regio ‘ s.

Met behulp van gegevens van dengue virus uitbraken in Queensland als een case-study, de tool identificeert en tracks van de nieuwe gevallen van infectie naar hun oorspronkelijke bron in Australië, en links hoe de ziekte wordt overgedragen tussen mensen.

Volgens Data61 computer wetenschapper Raja Jurdak, de traditionele methoden van het bijhouden van de infectie routes zijn vaak afhankelijk van tijdrovende site onderzoeken of interviews met betrekking tot de reisroutes van de geïnfecteerde patiënten.

Data61 heeft samen met Queensland Gezondheid te verkrijgen van volledig geanonimiseerde verslagen van de gerapporteerde dengue gevallen over een periode van 15 jaar. Jurdak vertelde ZDNet deze verslagen dienen als grond-waarheid gebruikt bij het trainen van de modellen.

“We gebruik van meerdere bronnen van informatie over mensen in beweging, met inbegrip van airline passenger data, geo-tagged sociale media, en toeristische onderzoeken, om te begrijpen hoe mensen zich bewegen tussen de regio’ s,” legde hij uit.

“Het gebruik van de menselijke beweging trends als uitgangspunt, onze aanpak leert hoe de ziekte zich verspreidt onder de regio’ s en de werkelijke gevallen gemeld aan het valideren van de resultaten.”

Jurdak zei deze methode kunt Data61 in het verleden te kijken en het identificeren van de bronnen van infectie, en ook het voorspellen van de potentiële toekomstige verspreiding van de ziekte.

Begrijpen hoe infecties verspreiden eenmaal aangekomen in Australië zal de gelegenheid bieden om te voorspellen wanneer en waar er een uitbraak dreigt te ontstaan, waardoor ziekenhuizen en biosecurity agentschappen om zo goed voorbereid als mogelijk.

Echter, één van de uitdagingen van het project is dat Data61 is het werken met beweging gegevens die dekt niet de gehele bevolking.

“Dit is de reden waarom wij gekozen voor een combinatie van meerdere gegevensbronnen op hoe mensen bewegen, zodat de vooroordelen van een dataset kan worden gecompenseerd door de anderen,” Jurdak vertelde ZDNet. “Omdat we gebruik gemaakt van de werkelijke gevallen gemeld om te trainen en te valideren ons model, wij zijn ervan overtuigd dat het model is robuust om de beperkingen van de afzonderlijke gegevensreeksen.”

De tool is onderdeel van de bredere Ziekte Netwerken en Mobiliteit (DiNeMo) project gericht op het ontwikkelen van een real-time alert en surveillance systeem voor de mens besmettelijke ziekten. Data61 verwacht dat het zal zorgen voor nieuwe inzichten in het gedrag van ziekten bij de mens gebracht in Australië.

Volgens Jurdak, de tool kan worden geschaald te controleren en volgen andere uitbraken van ziekten, waarbij de overdracht tussen mensen, dieren, of die worden verspreid via vectoren zoals parasieten, virussen en bacteriën.

“Omdat we gebruik maken van de beweging van mensen en dieren als de onderliggende factor van de verspreiding van de ziekte, kunnen wij passen onze aanpak aan een breed scala van uitbraken waar we wat informatie over de beweging van de agenten-mensen en dieren-betrokken in het verspreiden van proces,” voegde hij eraan toe.

Voorbeelden van andere toepassingen van het programma bevat onder meer malaria, die ook verspreidt zich via muggen, en mond-en klauwzeer in dieren.

VERWANTE DEKKING

Data61 voltooid 317 projecten in de eerste twee jaar van de werking
CSIRO bouwt analytics platform te helpen Aussie boeren
Op het scherm dieren krijgen een klein stukje van de royalty ‘ s pie dankzij Data61
CSIRO: Onze wetenschap startups zijn beter voor de economie dan techbros
CSIRO Innovatie Fonds back-technologie aan te pakken fruitvliegjes
CSIRO met serverloze het berekenen van de analyse van het menselijk genoom
CSIRO het betrekken van de Australiërs voor energie-onderzoek
AI platforms doel om te verlichten van informatie-overload in de gezondheidszorg en het verbeteren van de patiëntenzorg (TechRepublic)

Verwante Onderwerpen:

Australië

CXO

Digitale Transformatie

Tech Industrie

Smart Cities

Cloud