Onderzoekers van de Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation (CSIRO) Australische e-Health Research Centre ontwikkelden een meer krachtige manier om te zoeken naar de genen die een ziekte veroorzaken met behulp van kunstmatige intelligentie.
De software biedt een meer betrouwbare manier om te recreëren gen mutaties in het lab, aangeprezen door CSIRO als een stap dichter bij een betere diagnose en behandeling van genetische ziekten.
De nieuwe cloud-gebaseerde software, CUNE, is het resultaat van een samenwerking tussen CSIRO en de John Curtin School van Medisch Onderzoek van de Australian National University.
De software — gedetailleerde deze week in het Wetenschappelijke Rapporten — maakt HDR bewerkt, op basis van 83 procent efficiënter.
“Een enkele spelfout in de drie miljard letter lange menselijk genoom kan leiden tot levensbedreigende ziekten zoals mucoviscidose,” CSIRO Transformationele Bioinformatica Groep Leider Dr Denis Bauer zei.
“Om te proberen erachter te komen welke genetische mutaties veroorzaken van bepaalde ziekten, hebben de onderzoekers opnieuw deze mutaties in het equivalent gen in het lab — die van oudsher arbeidsintensief en traag, beperkt tot de diagnose van de ziekte in plaats van de behandeling.
Ze zei: AI zorgt voor een veel sneller en krachtiger instrument dan de bestaande basis technologie voor het bewerken.
Zoals uitgelegd door Bauer, onderzoekers gebruiken base-bewerken muteren specifieke letters in het genoom, maar deze methode kan alleen gebruikt worden voor sommige veranderingen, zoals het wijzigen van een “C” met een “T”, maar niet met Een “a”.
“HDR-gebaseerd nucleotide bewerken biedt een aangepaste DNA-sjabloon te kopiëren, waardoor onderzoekers te maken, elke verandering die zij nodig hebben-maar het is nooit een betrouwbare optie voor nu,” legde ze uit. “Onze software is de eerste software ter ondersteuning van HDR-nucleotide bewerken en maken het een meer betrouwbare editing tool.
“We hopen dat dit zal het gemakkelijker maken voor onderzoekers om te begrijpen van de genetische oorzaken van ziekten te ontwikkelen kuren en behandelingen — en het versnellen van het menselijk begrip van hoe het genoom, het werkt echt.”
De transformationele bio-informatica team dat Bauer leidt heeft het handvest tot het ontwikkelen van nieuwe bioinformatica oplossingen voor het onderzoek en de industrie, en maakt gebruik van de nieuwste cloud en BigData-infrastructuur.
Het zich specifiek richt op de bevolking-schaal analyse van genomics, transcriptomics, en methylomics, evenals genome engineering toepassingen.
Werken voor de eHealth research programma binnen CSIRO, die is de grootste digitale health agency in Australië, Bauer zei eerder dat de teams zijn gericht op het verbeteren van de gezondheidszorg door middel van het gebruik van digitale technologieën en diensten.
VERWANTE DEKKING
CSIRO met serverloze het berekenen van de analyse van het menselijk genoom
De CSIRO is het gebruik van AWS Lamba van een analyse van de 20 exabytes van gegevens afkomstig uit het genomics-per jaar.
Max Kelsen met behulp van Google ‘ s Cloud te helpen verslaan van kanker door middel van machine learning
De Australische firma heeft zich tot doel gesteld om het voorspellen van de effectiviteit van immunotherapie behandeling.
Hoe AI en de volgende generatie genome sequencing is het helpen van patiënten met kanker (TechRepublic)
Sophia Genetica maakt gebruik van kunstmatige intelligentie om te wijzen genmutaties achter kankers en zeldzame aandoeningen om zorgverleners te helpen voorschrijven van de beste behandelingen voor patiënten.
DeepMind AI plekken vroege tekenen van de ziekte van het oog
De eerste resultaten van DeepMind de samenwerking met Moorfield s Eye Hospital in Londen duiden erop dat een methode die gebruik maakt van kunstmatige intelligentie kan een snellere diagnoses en helpen voorkomen dat het zicht verlies.
Verwante Onderwerpen:
Australië
CXO
Digitale Transformatie
Tech Industrie
Smart Cities
Cloud