Noll
Den Garvan Institute of Medical Research har meddelat att man kommer att få en ny high-performance computing (HPC) system för att stödja genetisk forskning och analys.
Genomik är studiet av information som är kodad i en individs DNA, gör det möjligt för forskarna att studera hur gener påverkar hälsa och sjukdom, och det är institutets uppdrag att göra betydande bidrag till medicinsk forskning som kommer att förändra inriktningen av vetenskap och medicin och har stor inverkan på människors hälsa.
Den nya superdatorer systemet, som levereras av Dell EMC, kommer att användas av Garvan Data Intensiv datateknik (DICE) – gruppen.
Den Garvan Institute är en av Australiens största medicinska forskningsinstitut, som särskilt fokuserar på forskning om cancer, diabetes och metabolism, genomik och epigenetik, immunologi och inflammation, benskörhet och ben biologi och neurovetenskap.
Enligt Dr Warren Kaplan, chef för informatik vid Garvan är Kinghorn Centrum för Klinisk Genomik, genomik kräver betydande datorkraft för att analysera data.
“Vi vill ändra riktning på medicin och har en livsomvälvande inverkan på människors hälsa. Vi ser genomik som är viktigt för att driva denna omvälvande förändring, och vi kunde inte uppnå detta utan att it-infrastruktur för att göra det möjligt”, säger Kaplan.
Se även: I bilder: världens 25 snabbaste superdatorer (TechRepublic)
Enligt National Human Genome Research Institute, när den första mänskliga genomet var ordnat, det projekt som inleddes under 1990 tog över 10 år och kosta runt $2,7 miljarder kronor.
Nu Garvan kan sekvensen upp till 50 genomen per dag på en bas pris på runt $1000.
För att lagra, analysera och använda denna genomisk information på ett effektivt sätt, Garvan kräver stora dataresurser och lagring av data — varje persons genetiska data innehåller över 6 miljarder baser och runt 5 miljoner genetiska varianter, med upp till 700 timmar att bearbeta.
“Tekniken har förändrat sättet som vi gör vetenskap”, Kaplan fortsatte. “Det har gett oss förmågan att förvandla Garvan i en data-driven medical research institute, och mer genomen vi sekvens, ju mer vi kan använda denna information för att informera framtida studier.”
Det nya systemet förväntas stödja flera genomiska dataset, inklusive Sydney Genomics Collaborative och den Medicinska Genomet Hänvisning Bank, och kommer att hjälpa till att driva den Australiska Genomisk Cancer Medicin-Programmet och andra initiativ, institutet sagt.
TÄRNINGARNA HPC-system har byggts på Dell EMC: s 14: e generationens PowerEdge-high-performance computing-teknik.
Över 47 Dell EMC PowerEdge-servrar, lösningen kommer att tillhandahålla kliniska forskare med genomik kapacitet för hantering av 1,632 Intel Xeon Skalbar processorkärnor; 10 Intel Arria 10 GX Fpga: er; 122,880 Nvidia Tesla V100 CUDA-kärnor; 15,360 Nvidia Tensor kärnor, förväntas accelerera HPC och AI-tekniker, 744TB av NVMe att påskynda minne behandling av genomet datamängder; 41TB DDR4 RAM-Minne, och 530TB användbar kapacitet CephFS lagring.
TIDIGARE OCH RELATERADE TÄCKNING
University of Sydney presenterar AU$2,3 m Artemis 3 AI-forskning superdator
Drivs av Dell EMC uppgradering till Artemis förväntas ge ytterligare forskning inom artificiell intelligens.
Medicinsk bildbehandling vid “speed of light”: Nvidia: s superdator Clara
Nvidia VD och grundare Jensen Huang sade vetenskap behov super laddade datorer, så det är därför att hans företag är att bygga dem.
Swinburne når upp till himlen med AU$4m astronomiska superdator
Dell EMC-drivna superdator kommer att användas av universitetet för att driva en ny ålder av gravitationell våg astrofysik, som bygger på Albert Einsteins teori om 100 år.
CSIRO får djup inlärning superdator från Dell EMC
Med en budget på AU$4 miljoner, Australien forskning organisation som undertecknat Dell EMC att bygga sin nya artificiell intelligens-fokuserad scientific computing system, Bracewell.
Relaterade Ämnen:
Australien
CXO
Digital Omvandling
Tech-Industrin
Smarta Städer
Cloud
0