< p class = "meta"> Av Aimee Chanthadavong | 29. september 2021 | Tema: Innovasjon
Bilde : Getty Images
I et forsøk på å få fart på koalabevaringsarbeidet har University of Sydney (USyd) slått seg sammen med Amazon Web Services for å demokratisere genomdataene til 450 koalaer ved å etablere et skybasert koala genombibliotek .
USyd har opprinnelig gjort 96 sekvenserte koala -genomer tilgjengelige. Det vil være det første av flere partier av de 450 koala -genomene som vil bli gjort tilgjengelig i år.
Målet med demokratisering av forskningsdataene for USyd er at forskerne kan jobbe med forskere og naturvernere for å dele forskningsinnsikt, funn og bruke løsninger raskere – noe som ikke tidligere har vært mulig som behandling og analyse genomdata kan ofte ta år.
“Den beste måten å beskytte koalabestanden er generelt å slutte å felle trærne deres,” sa forskningssjef i USyd Australasian Wildlife Genomics Group, dr. Carolyn Hogg.
“Men så mye som mange av oss vil si,” la oss bare slutte med det “, må vi være realistiske. Vi kan ikke stoppe utviklingen. Vi må finne flere kreative løsninger for disse problemene, og ikke bli knyttet til verktøy vi utviklet på 90 -tallet. ”
Hun la til at dataene kan hjelpe forskere å sammenligne og forstå mangfoldet av koala -artene.
“Koalaer fra Queensland pleier å være litt mindre og brunere i fargen, mens koalaer i Victoria har en tendens til å være større, grå og luftigere,” sa Hogg.
“Variasjonsnivået hadde fått mange forskere til å tro at det kan være to separate koala -arter, til koala -referansegenomet ble sekvensert og bevist at dette var feil.
“Ved å generere dette nye, bredere genomdatasettet kan vi begynne å stille spørsmål som:” Har koalaer som bor i vest genvarianter som vi ikke ser på østkysten, hvor det er kaldere og våtere – så er disse genene potensielt viktige for å håndtere klimaendringer? '”
Arbeidet mellom universitetet og AWS er en del av sponsingsprogrammet for AWS Open Data. Under programmet dekker AWS lagringskostnadene for datasett av høy verdi for det vitenskapelige samfunnet og gjør det tilgjengelig for tilgang og analyse i skyen.
Prosjektet, som har støtte fra den føderale regjeringen og New South Wales -regjeringen, bygger på tidligere koalagenomsekvensering som USyd utførte i 2018.
Å benytte AWS -sky for genom -sekvensering er imidlertid ikke nytt for USyd. I fjor ledet Hogg også anklagen om genomisk forskning for å forhindre at den tasmanske djevelen utryddes.
Begge prosjektene faller inn under USyd's Threatened Species Initiative, som Hogg leder. Prosjektet ble lansert i mai 2020 og har generert ressurser for 62 arter, som alle til slutt vil være tilgjengelige på AWS Open Data -sponsingsprogrammet.
“Jeg begynte å jobbe med AWS fordi jeg hadde så mye data og jeg kunne ikke ikke behandle det effektivt ved å bruke de lokale IT-systemene vi hadde, sier Hogg. “Vi var i stand til å redusere dataanalyse fra 10 dager til bare fem timer ved hjelp av AWS. Da jeg innså kraften i å jobbe i skyen, oppmuntret det meg til å gå utover mitt biologiske område og begynne å finne folk som jobber på andre felt av ekspertise. ”
Annet koala bevaringsarbeid utføres for tiden i Sør -Australia og Queensland, som begge bruker droner for å gi mer nøyaktige estimater om antall overlevende koalaer i hver stat.
RELATERT DEKNING
Forskere ved Murdoch-universitetet utvikler droneteknikk for grid-system for å kartlegge dugongsSkal opp på en shoestring mens borgerforskere analyserer Great Barrier ReefAustralias Ceres Tag som konverterer husdyr til IoT-enheter Wildlife Watch and the Black Mambas: Bruke smarttelefoner og videostrømmer for å beskytte dyr
Relaterte emner :
Australia CXO Digital Transformation Tech Industry Smart Cities Cloud 
Av Aimee Chanthadavong | 29. september 2021 | Tema: Innovasjon