Intel hjælper forhånd genomics analytics med nye arkitektur

0
144

Mindre end et år efter at udvide sit partnerskab med Broad Institute of Harvard og MIT, for at fremme brugen af high-performance computing for genomics analytics, Intel annoncerer nogle milepæle.

Intel og Bredt har udviklet en ny reference arkitektur, kaldet Bred-Intel Genomics Stack (BIGstack), som leverer en 5X forbedring at Brede s genomics analytics pipeline. Det bruger Intel ‘s Cpu’ er, Omni-Sti Stof, og Ssd ‘ er. Stakken indeholder også optimeringer for Intels integrerede CPU og Fpga ‘ er.

Den nye struktur understøtter data-diskenheder “på virkelig hidtil uset omfang,” skrev Jason Waxman, corporate VP og GM i datacenter Solutions Group i Intel, i et blog-indlæg.

Med denne form for avancement i genomics analytics, skrev han, “vi kan tage nye skridt mod forståelse af den molekylære førere af kræft og andre sygdomme, og at fremskynde løfte om præcision medicin.”

BIGstack er nu tilgængelig til 45,000 registrerede brugere af GATK, Brede s genomics analyse toolkit. Waxman kaldte det “den slags gennembrud i pris for genomforskning analytics fællesskab”, at Intel havde i tankerne, når det har begået $25 millioner til sin fem-årige samarbejde med de Overordnede Institute sidste år.

I mellemtiden, Intel meddelte også, at den Brede Institute er open-sourcing GATK4.

Derudover, BGI — en leder i Kina er inden for industrien — vedtager GATK værktøjer, herunder GATK4, Bred ‘ s workflow management system Cromwell og WDL (workflow definition language) på BGI Online platform. Flytningen skal hjælpe med at rette inden for forskning i hele verden, Waxman sagde.

A problem-solving approach IT workers should learn from robotics engineers

En problemløsende tilgang til IT-medarbejdere skal lære af robotteknologi ingeniører

Nogle gange er den mest dybtgående løsning er at ændre hele problemet.