Data61 onderzoekers ontwikkelen van software voor de vroegtijdige opsporing van kanker

0
138
cancer-detection-csiro.png

Een vergelijking van de verbeterde bloedvat voorafgaand aan skeletonisation (links) en na de eind-punt skeletonisation proces (rechts).

Afbeelding: CSIRO Data61

De Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation (CSIRO) heeft aangekondigd dat de onderzoekers van de Data61 divisie zijn in het ontwikkelen van software die het mogelijk kunnen maken de vroege detectie van kwaadaardige tumoren.

Specifiek, de software is gebouwd om te detecteren angiogenese de ontwikkeling van nieuwe bloedvaten, die voorafgaat aan de groei van kanker.

Onderzoekers van Data61 en het Shanghai Institute of Applied Physics aan de Chinese Academie van Wetenschappen geanalyseerd 26 hoge-resolutie 3D micro-CT-beelden van de hersenen en lever van 26 muizen in verschillende stadia van de groei van kanker en een algoritme ontwikkeld dat zorgt voor wat CSIRO vorderingen is een nauwkeurige geometrische representatie van de bloedvaten.

De onderzoekers pasten een techniek genaamd “end-point beperkingen” voor het behoud van de geometrische eigenschappen van nieuwe bloedvaten, met inbegrip van vertakking patronen en de lengte van de terminal van de schepen.

“De nauwkeurige kwantificering van de vaatstelsel veranderingen, in het bijzonder het aantal terminal schip takken, een cruciale rol kan spelen in nauwkeurige beoordeling en behandeling,” CSIRO zei.

Vroeger afbeeldingen van de bloedvaten structuur afkomstig van de hoge-resolutie beelden waren alleen in staat om te produceren een skeletonised weergave van de bloedvaten structuur die beperkt detail en nauwkeurigheid, volgens CSIRO.

Data61 de nieuwe software zal de monitoring van subtiele proliferations in de bloedvaten na verloop van tijd, een beter inzicht te verschaffen van hoe patiënten reageren op de anti-angiogenese behandeling.

Cancer Council Australia CEO professor Sanchia Aranda zei de capaciteit van kankers van het vormen van nieuwe bloedvaten is een kritische functie, waarmee kankercellen uitzaaien.

“De hoop is dat door een verbeterd inzicht in nieuwe mogelijkheden te verstoren angiogenese worden geïdentificeerd en opent wegen naar nieuwe behandelingen,” Aranda zei. “Als we stoppen kankers verspreiden kunnen we verminderen het aantal mensen die sterven aan de ziekte.”

CSIRO toegelaten dat terwijl de ontwikkeling van deze nieuwe techniek is een “belangrijke stap voorwaarts”, de Shanghai Synchrotron Bundellijn dat werd gebruikt voor de productie van de micro-CT 3D-beelden van muizen organen daadwerkelijk genereert de straling die onveilig zijn voor de menselijke beeldvorming.

Als zodanig, de onderzoekers zijn op zoek naar 3D-imaging-technologieën en de samenwerking met een fabrikant van hardware die de productie van hoge-resolutie afbeeldingen met veilige niveaus van straling voor de mens.

Dr Dadong Wang, leiden onderzoeker op dit project van Data61 het Quantitative Imaging team, zei dat de software wordt gebouwd kon worden toegepast in andere gebieden, zoals de analyse van 3D neurieten uitgroei voor de ontwikkeling van geneesmiddelen.

“Terwijl er grote belangstelling om deze bevindingen verder, er is nog een lange weg te gaan voordat deze nieuwe ontwikkeling kan worden toegepast op menselijke patiënten,” Wang zei. “Maar we zijn erg hoopvol, en op dit moment op zoek naar medewerkers en partners om de techniek naar de volgende fase.”

Dit is niet de eerste keer CSIRO heeft gekeken naar opsporing van kanker; in December, de overheid gesteunde organisatie aangekondigd dat een nieuwe, meer nauwkeurige bloed test voor het opsporen van darmkanker herhaling, bekend als Colvera, had gelanceerd in de Verenigde Staten.

De bloedtest, die spoort kanker-specifieke chemische veranderingen in stukjes DNA uit tumoren te vinden circuleren in het bloed, is het resultaat van een samenwerking tussen de CSIRO, Flinders University, en Klinische Genetica.

De in californië woonachtige Guardant Gezondheid is ook op zoek naar vroege opsporing van kanker en onlangs verhoogd van $360 miljoen met de volgorde van de tumor DNA van meer dan 1 miljoen kankerpatiënten binnen vijf jaar, en gebruiken de gegevens om het ontwikkelen van bloed-gebaseerde tests voor de vroege opsporing van kanker.

Freenome, South San Francisco-based vloeibaar biopt opstarten die gebruik maakt van een combinatie van machine learning en biologie voor het detecteren van de cel-gratis DNA-sequencing van kanker voordat het wordt dodelijk, heeft verhoogd $71,2 miljoen euro-to-date, $65 miljoen, die werd opgetrokken in Maart van dit jaar. Een van Freenome beleggers, Google Ventures, heeft ook een back-Freenome concurrent Graal.

In januari, Graal, een spin-off van de NASDAQ-genoteerde DNA-sequencing reus Illumina, ook verhoogd $900 miljoen in een Serie B ronde Boog geleid door Venture Partners, met inbreng van andere investeerders, zoals Johnson en Johnson ‘ s innovatie arm.