Garvan Institute får nye supercomputer for genom-forskning

0
84

Nul

Den Garvan Institute of Medical Research har meddelt, at den vil blive modtaget en ny high-performance computing (HPC) system til støtte for genom-forskning og analyse.

Genomics er studiet af oplysninger, der er kodet ind i en persons DNA, gør det muligt for forskerne at studere, hvordan gener betydning for sundhed og sygdom, og det er instituttets mission om at yde væsentlige bidrag til den medicinske forskning, der vil ændre retninger af videnskab og medicin og har stor indflydelse på menneskers sundhed.

Den nye supercomputing-system, skal leveres af Dell, EMC, vil blive brugt af Garvan Data-Intensive Computer Engineering (DICE) gruppe.

Den Garvan Institute er en af Australiens største medicinske forskningsinstitutioner, der fokuserer specifikt på forskning i kræft, diabetes og metabolisme, genomforskning og epigenetik, immunologi og inflammation, osteoporose og knogle biologi og neurovidenskab.

Ifølge Dr. Warren Kaplan, chef for informatik på Garvan er Kinghorn Center for Clinical Genomics, genomik kræver stor regnekraft til at analysere data.

“Vi ønsker at ændre retningen af medicin og har et liv skiftende indvirkning på menneskers sundhed. Vi kan se, genomics som nøglen til at opnå dette transformativ forandring, og vi kunne ikke opnå dette uden it-infrastruktur for at gøre det muligt,” Kaplan sagde.

Se også: billeder: verdens 25 hurtigste supercomputere (TechRepublic)

Ifølge National Human Genome Research Institute, når de første menneskelige genom blev sekventeret, projektet, der begyndte i 1990 tog over 10 år og koste omkring $2,7 mia.

Nu Garvan kan sekvens på op til 50 genomer per dag på en base pris af omkring $1.000.

Til at gemme, analysere og bruge denne genomisk information effektivt, Garvan kræver store it-ressourcer og lagring af data — hver persons genom-data indeholder over 6 milliarder baser og omkring 5 millioner genetiske varianter, der tager op til 700 timer til processen.

“Teknologi har ændret den måde, vi gør videnskab,” Kaplan fortsatte. “Det har givet os evnen til at omdanne Garvan i en data-drevet medical research institute, og flere genomer vi sekvens, jo mere vi er i stand til at bruge disse oplysninger til at informere fremtidige undersøgelser.”

Det nye system forventes at understøtte flere genomisk datasæt, herunder Sydney Genomics Samarbejde og den Medicinske Genom Reference Bank, og vil hjælpe med at drive den Australske Genomisk Cancer Medicin Program og andre initiativer, institut sagde.

TERNINGERNE HPC-system er bygget på Dell, EMC ‘ s 14 generation af PowerEdge-high-performance computing-teknologi.

Hele 47 Dell, EMC PowerEdge-servere, den løsning vil give kliniske forskere med genomics kapacitet til forarbejdning af 1,632 Intel Xeon Skalerbar processorkerner; 10 Intel Arria 10 GX Fpga; 122,880 Nvidia Tesla V100 CUDA kerner; 15,360 Nvidia Tensor kerner, der forventes at accelerere HPC-og AI-teknikker; 744TB af NVMe til at accelerere i hukommelsen behandling af genom-datasæt; 41TB DDR4 RAM-Hukommelse; og 530TB anvendelige kapacitet CephFS opbevaring.

TIDLIGERE OG RELATEREDE DÆKNING

University of Sydney lancerer AU$2,3 m Artemis 3 AI forskning supercomputer

Drevet af Dell, EMC, opgradere til Artemis forventes at give mulighed for yderligere forskning i kunstig intelligens.

Medicinsk billedbehandling på “speed of light”: Nvidia ‘ s Clara supercomputer

Nvidia CEO og grundlægger Jensen Huang sagde videnskab behov super-charged-computere, så det er derfor, hans virksomhed er at opbygge dem.

Swinburne når op til himlen med AU$4m astronomiske supercomputer

Dell EMC-drevet supercomputer vil blive brugt af universitetet til magten i en ny tidsalder af gravitationel bølge astrofysik, som bygger på Albert Einstein ‘ s teori 100 år.

CSIRO modtager dyb læring supercomputer fra Dell, EMC

Med et budget på AU$4 millioner, Australien ‘ s forskning organisation, der har underskrevet Dell, EMC-at bygge sin nye kunstige intelligens-fokuseret scientific computing system, Bracewell.

Relaterede Emner:

Australien

CXO

Digital Transformation

Tech-Branchen

Intelligente Byer

Cloud

0